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Folding@Home, un projet scientifique généreux

Popularisés par le célèbre Seti@home, les projets distribués fleurissent sur le net. Dans la lignée du Décrypthon, Folding@home est actuellement le projet distribué le plus prometteur : il s'agit d'un projet biomédical qui étudie le repliement des protéines humaines afin de mieux comprendre et traiter de nombreuses maladies, comme celle de Creutzfeld-Jakob, d'Alzheimer, ou le cancer.


Depuis plusieurs années les chercheurs en biologie moléculaire ont démontré, par l'observation et l'expérimentation, que l'action d'une protéine est liée à sa forme en 3 dimensions.

L'état actuel des connaissances nous apprend que de nombreuses maladies, génétiques ou non, se traduisent par des anomalies dans la forme des protéines.
L'exemple le plus célèbre étant le prion (responsable de la tremblante du mouton, des maladies de la vache folle et de Creutzfeld-Jakob).
D'autres exemples de maladies impliquant une mauvaise conformation des protéines sont la maladie d'Alzheimer et de nombreux cancers.

Il est donc important, connaissant la formule chimique d'une protéine, de connaître également les différentes formes qu'elle peut prendre en se repliant, ceci pouvant déterminer son caractère "normal" ou "anormal", inoffensif ou pathogène.


Ce repliement étant trop rapide pour être observé "in vivo", une équipe de recherche de l'Université de Stanford, animée par le professeur Vijay Pande, le Pande Group, a décidé d'avoir recours à la simulation informatique pour remédier à cette impossibilité. Il s'agit du projet Folding@home.

Cette simulation nécessite une énorme puissance de calcul qui représente un investissement financier hors de portée de la plupart des services de recherche universitaires.

En se fondant sur le modèle adopté par l'Université de Berkeley pour le projet Seti@Home, Le Pande Group fait appel à la technique du calcul distribué qui consiste à "découper" en petites unités indépendantes les calculs à effectuer pour les répartir entre de très nombreux ordinateurs du type ordinateur personnel (Mac ou PC).

Pour obtenir la puissance de calcul nécessaire à un avancement rapide des recherches, le Pande Group fait appel, dans le monde entier, aux possesseurs d'ordinateurs personnels, disposant d'une connexion à l'Internet, pour offrir au projet la puissance inutilisée de leurs machines.

En effet, sur un plan statistique, on peut constater que près de 95% de la puissance des ordinateurs de type personnel est inemployée. En clair nos ordinateurs passent 95% de leur temps à attendre que nous leur fassions exécuter une tâche, laquelle tâche ne requiert que rarement la totalité de la puissance disponible.

Pour participer à ce projet il suffit de télécharger depuis le site de l'Université de Stanford un logiciel appelé "client" qui, une fois installé et configuré, va appeler un serveur de Folding@home, charger une unité de travail (WU), effectuer les calculs, renvoyer les résultats au serveur, charger une nouvelle unité, et ainsi de suite, aussi longtemps que vous souhaiterez contribuer à ce projet scientifique.

Actuellement (Février 2003) près de 90. 000 ordinateurs calculent pour Folding@home...

Deux questions reviennent souvent :

1) Folding@home va-t-il ralentir mon ordinateur quand je veux m'en servir ?


La réponse est NON !

Les systèmes d'exploitation sont capables d'attribuer des niveaux de priorité différents selon les applications.

Le client Folding@home est programmé pour adopter le niveau de plus basse priorité.

En clair, dès que votre utilisation de l'ordinateur requiert de la puissance, le client Folding@home la libère, au fur et à mesure et la reprend dès que vous n'en avez plus besoin.


2) Qui va profiter des résultats de ce projet ?

En contrepartie du bénévolat des participants au projet, l'Université de Stanford s'est engagée sur 2 points essentiels :
aucun brevet ne sera déposé sur les résultats obtenus par le projet
tous les résultats sont disponibles gratuitement pour les chercheurs du monde entier


Des résultats du Pande Group ont déjà été publiés dans la revue scientifique Nature, repris dans la presse américaine dont quelques traductions ont été réalisées par des membres de l'Alliance Francophone dans ce dossier de presse http://www.alliancefrancophone.org/dossiers.html

L'article paru dans Nature fait état, en particulier, de la conformité des résultats obtenus par la simulation avec ceux obtenus par l'expérimentation directe en laboratoire par des équipes indépendantes du Pande Group, ce qui valide définitivement la méthode employée par le projet Folding@home.

Pour en savoir davantage sur le projet, l'installation du programme, poser toutes les questions qui vous passent par la tête sur ce sujet, vous pouvez vous rendre sur le site de l'Alliance Francophone http://www.alliancefrancophone.org/ (qui rassemble plus de 2700 participants francophones dont pres de 1250 actifs) et l'explorer en détail.

Puis, si vous avez encore des questions ou des difficultés, envie de vous informer sur l'actualité du projet, ou tout simplement de papoter, nous avons un Forum très vivant où nous vous accueillerons avec plaisir et humour.

Alors n'hésitez plus http://www.alliancefrancophone.org/
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Re: Folding@Home, un projet scientifique généreux
Posté par turlupin le 20/08/2004 07:53:45
Mais non, Loello !

La poudre de perlimpinpin et la bave de crapaud sont les seuls remèdes efficaces, c'est bien connu !

Je te rappelle, au passage, qu'il y a 40 ans le SIDA n'existait pas

Franchement, atteindre un tel niveau de connerie a dû te demander bien des efforts qui auraient été mieux employés à t'instruire.

Arrivé à ce point de bêtise irrationnelle et d'ignorance crasse, aucun argument sensé ne peut t'atteindre, je ne vois donc plus que le suicide pour régler ton problème, car, si tu es à ce point convaincu de ce que tu dis, la vie doit t'être insupportable.

Je vais signaler ton post à mes amis qui participent au projet, ça leur fera une bonne occasion de rigoler, ça aura au moins eu cette utilité...

Si j'avais du temps à perdre je te plaindrais presque mais, la vie étant ce qu'elle est, tu ne m'en voudras pas si je m'occupe de choses plus intéressantes.
Re: Folding@Home, un projet scientifique généreux
Posté par magdalena! le 20/08/2004 07:53:45
bon...tout d'abord,VIVE LES MELONS...
c'est vrai que en soi,c'est une bonne idée ce projet!tu y participes toi???
Moi(tu me connais plus que bien il me semble...),je ne le ferai pas.certains disent que ça coute 20 euros de plus par an,et ensuite,si ça met des bogues comme ils le disent,ben tu vas passer ta vie chez moi à réparer toutes mes conneries et voila quoi.
mais c'est vrai que le projet scientifique est une vraiment bonne idée de leurs part...
Mais je te félicite:ton article est vraiment tres bien fait pour quelqu'un qui bosse jamais,bien qu'il soit en "S"¨Parceque bon...je veux pas dire,mais les scientifiques,ils parlent beaucoup plus qu'ils ne bossent...3 p'tis points...


gros bisous toto!!!melon!
Re: Folding@Home, un projet scientifique généreux
Posté par turlupin le 20/08/2004 07:53:45
>Par nbr le 4 août 2003 : J'ai déjà participé au projet Folding@home mais je l'ai rapidement abandonné :

Je participe à ce projet depuis 2 ans et ai donc un peu plus de recul sur le sujet.

>- unités trop longues et boguées,

Avec un 486, c'est sûr que tu dois trouver le temps long... (joke inside)

>- pas assez de transparence dans logiciel (ok, il calcule le repliement des protéines, mais qu'est-ce qu'il en fait après ?),

On n'apprend plus à lire à l'école ?

Il y a des tonnes de documentation sur le projet, sur les résultats actuels et leur publication dans Nature et le JMB.

Sans compter les pages de docs réalisées par les membres de l'Alliance francophone sur le site de l'Alliance, et les centaines de messages dans les forums de l'Alliance.

http://www.alliancefrancophone.org/bienvenue.html

http://forum.presence-pc.com/forum.php3?config=foldinghome.inc&i nterface=

>- la consommation électrique du processeur augmente de 50 W (ça me coûte 20 EUR par an).

Ciel ! Combien dépenses-tu en conneries diverses chaque mois ? (SMS, cigarettes, autres)

>En bref ça ne pose que des problèmes.

t'as raison, continue de faire joujou avec tes gadgets sans te poser de questions sur le monde qui t'entoure.
Re: Folding@Home, un projet scientifique généreux
Posté par nbr le 20/08/2004 07:53:45
J'ai déjà participé au projet Folding@home mais je l'ai rapidement abandonné :
- unités trop longues et boguées,
- pas assez de transparence dans logiciel (ok, il calcule le repliement des protéines, mais qu'est-ce qu'il en fait après ?),
- la consommation électrique du processeur augmente de 50 W (ça me coûte 20 EUR par an).
En bref ça ne pose que des problèmes.
nbr
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Publié le 20 juillet 2003
Modifié le 20 juillet 2003
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